L'Università di Pisa è stata fondata nel 1343. È una delle università più rinomate d'Italia, composta da 20 Dipartimenti, con centri di ricerca di alto livello nei settori dell'agricoltura, della fisica, dell'informatica, dell'ingegneria, della medicina umana e veterinaria. Secondo le classifiche internazionali, UNIPI si colloca al 133° posto (nel top 20%) in Europa e al 7° in Italia. UNIPI ha partecipato a 206 progetti europei nell'ambito di Horizon 2020 e di altri programmi europei (durante l'ultimo ciclo di programmazione europea, ovvero dal 2014 al 2020), per un finanziamento totale di 68,3 milioni di euro. Ha coordinato 51 progetti europei, per un finanziamento totale di 30,3 milioni di euro. In AGROFIG, UNIPI è rappresentata da quattro diversi team del Dipartimento di Scienze Agrarie, Alimentari e Agro-ambientali (DiSAAA). 
- Il team PAGE (Pisa Agricultural Economics) lavora da anni per comprendere e promuovere la transizione verso sistemi agroalimentari sostenibili e resilienti, coordinando progetti con il coinvolgimento di stakeholder legati alla filiera alimentare, come H2020 DIVINFOOD o EU Horizon GRANULAR. I temi affrontati dal gruppo di ricerca includono lo sviluppo di metodologie partecipative nell'analisi dei sistemi alimentari e delle "catene del valore" nei sistemi agroalimentari, l'identificazione di asimmetrie informative e degli impatti sulla sostenibilità delle diverse filiere. Questo team parteciperà principalmente alla raccolta di dati sull'adozione dell'agroforestazione in Italia (task 1.1), all'organizzazione di un Living Lab con stakeholder in Italia (task 1.2) e alla creazione di collegamenti con l'amministrazione pubblica (task 1.3). 
- Il team di Genetica Agraria ha competenze in genomica strutturale vegetale, genotipizzazione di specie vegetali mediante marcatori molecolari, biologia molecolare e bioinformatica. Recentemente, questo team ha coordinato il progetto FIGGEN, dove, seguendo un approccio partecipativo con il coinvolgimento degli stakeholder, circa 300 genotipi di fico provenienti da collezioni spagnole, turche e tunisine sono stati caratterizzati a livello genotipico e fenotipico. I suoi compiti in AGROFIG sono il coordinamento del progetto (WP0), l'analisi di genotipizzazione di cultivar di fico (Task3.2), e le attività di comunicazione e divulgazione (WP4). 
- Il team di Agronomia ha competenze in agroecologia e sistemi colturali diversificati, ottenuti attraverso l'introduzione di miscele varietali, consociazioni e colture di copertura in agricoltura biologica e gestione integrata dei parassiti (IPM). Recentemente ha ampliato il suo interesse ai sistemi agroforestali, attraverso l'implementazione di esperimenti di campo sia a lungo termine (ad esempio, l'esperimento ARNINO a lungo termine, avviato nel 2017 presso il Centro di Ricerca Agroambientale "Enrico Avanzi" dell'Università di Pisa su un'area di circa 40 ettari) che a breve termine per testare l'adattabilità di diverse specie erbacee a condizioni agroforestali reali e simulate. Particolare attenzione è sempre stata rivolta agli effetti dei sistemi colturali sulla fertilità del suolo, con particolare attenzione alla dinamica della sostanza organica del suolo e al potenziale di mitigazione delle emissioni di gas climalteranti in atmosfera. Il suo compito è quello di contribuire alla realizzazione di un sito dimostrativo di agroforestazione in Italia e di misurare parametri relativi alla produzione, ai servizi ecosistemici, alla mitigazione climatica e alla salute del suolo (Task 2.1, 2.2). Si occuperà inoltre degli aspetti finanziari del sistema agroforestale organizzato nel sito dimostrativo (Task 2.4). 
- Il gruppo di Microbiologia dell'UNIPI ha competenze negli studi sul ruolo dei microrganismi nella produzione primaria, nella conservazione della diversità biologica del suolo, nella fertilità e nella nutrizione delle piante, partecipando a progetti incentrati sulle biotecnologie per l'agricoltura sostenibile e sull'uso di agenti microbiologici come biostimolanti e biofertilizzanti. Recentemente è coinvolto in un progetto incentrato sulla caratterizzazione del microbioma del suolo attraverso approcci metagenomici. Il suo compito è analizzare le dinamiche delle comunità batteriche e fungine in campioni di suolo raccolti da siti dimostrativi (Task 2.3). 

Usai G., Mascagni F., Giordani T., Vangelisti A., Bosi E., Zuccolo A., Ceccarelli M., King R., Hassani-Pak K., Solorzano Zambrano L., Cavallini A. and Natali L. Epigenetic patterns within the haplotype phased fig (Ficus carica L.) genome. The Plant Journal, 2020, 102, 600–614.
Vangelisti A., Solorzano Zambrano, L. Caruso G., Macheda D., Bernardi R., Usai G., Mascagni F., Giordani T., Gucci R., Cavallini A., Natali L.. How an ancient, salt-tolerant fruit crop, Ficus carica L., copes with salinity: a transcriptome analysis. Scientific Reports, 2019, 9:2561.
Agnolucci M., Avio L., Pepe A., Turrini A., Cristani C., Bonini P., Colosimo F., Ruzzi M., Giovannetti M. (2019). Bacteria associated with a commercial AMF inoculum: community composition and multifunctional activity as assessed by Illumina sequencing and culture-dependent tools. Frontiers in Plant Science 9:1956.
Knickel M., Caniglia G., Knickel K., Šūmane S., Maye D., Arcuri S., ... & Brunori G. (2023). Lost in a haze or playing to partners’ strengths? Learning to collaborate in three transdisciplinary European Living Labs. Futures, 152, 103219.
Tramacere, L.G., Antichi, D.*, Mele, M., Ragaglini, G., Mantino, A. (2024). Effects of intercropping on the herbage production of a binary grass-legume mixture (Hedysarum coronarium .L and Lolium multiflorum Lam.) under artificial shade in Mediterranean rainfed conditions. Agroforestry Systems, 98/6), 1445-1460. doi:10.1007/s10457-024-01012-8 caratterizzazione del microbioma del suolo attraverso approcci metagenomici. Il suo compito è analizzare le dinamiche delle comunità batteriche e fungine in campioni di suolo raccolti da siti dimostrativi (Task 2.3).