L'université de Pise a été fondée en 1343. Elle est l'une des universités les plus renommées d'Italie et compte 20 départements, avec des centres de recherche de haut niveau dans les domaines de l'agriculture, de la physique, de l'informatique, de l'ingénierie, de la médecine humaine et vétérinaire. Selon les classements internationaux, l'UNIPI se classe 133e (dans les 20 % supérieurs) en Europe et 7e en Italie. L'UNIPI a participé à 206 projets européens dans le cadre d'Horizon 2020 et d'autres programmes européens (au cours du dernier cycle de programmation européen, c'est-à-dire de 2014 à 2020), pour un financement total de 68,3 millions d'euros. Elle a coordonné 51 projets européens, pour un financement total de 30,3 millions d'euros. Au sein d'AGROFIG, l'UNIPI est représentée par quatre équipes différentes du département d'agriculture, d'alimentation et d'environnement (DAFE).
- L'équipe PAGE (Pisa Agricultural Economics) travaille depuis des années à la compréhension et à la promotion de la transition vers des systèmes agroalimentaires durables et résilients, en coordonnant des projets impliquant des acteurs liés à la chaîne de valeur alimentaire, tels que H2020 DIVINFOOD ou EU Horizon GRANULAR. Les thèmes abordés par le groupe de recherche comprennent le développement de méthodologies participatives dans l'analyse des systèmes alimentaires et des « chaînes de valeur » dans les systèmes agroalimentaires, l'identification des asymétries d'information et les impacts sur la durabilité des différentes chaînes d'approvisionnement.
Cette équipe participera principalement à la collecte de données sur l'adoption de l'agroforesterie en Italie (tâche 1.1), à l'organisation d'un laboratoire vivant avec les parties prenantes en Italie (tâche 1.2) et à l'établissement de liens avec l'administration politique (tâche 1.3). 
- L'équipe de génétique agricole possède une expertise en génomique structurale des plantes, en génotypage des espèces végétales à l'aide de marqueurs moléculaires, en biologie moléculaire et en bio-informatique. 
Récemment, cette équipe a coordonné le projet FIGGEN dans le cadre duquel, suivant une approche participative impliquant les parties prenantes, environ 300 génotypes de figues provenant de collections espagnoles, turques et tunisiennes ont été caractérisés au niveau génotypique et phénotypique. Ses tâches dans le cadre d'AGROFIG sont la coordination du projet (WP0), l'analyse génotypique des cultivars de figues (tâche 3.2) et les activités de communication et de diffusion (WP4).
L'équipe d'agronomie possède une expertise en agroécologie et en systèmes de culture diversifiés, acquise grâce à l'introduction de mélanges variétaux, de cultures intercalaires et de cultures de couverture dans l'agriculture biologique et la lutte intégrée contre les ravageurs. Elle a récemment élargi son champ d'intérêt aux systèmes agroforestiers, grâce à la mise en œuvre d'expériences à long terme (par exemple, l'expérience à long terme ARNINO, lancée en 2017 au centre de recherche agro-environnementale « Enrico Avanzi » de l'université de Pise sur une superficie d'environ 40 ha) et d'expériences à court terme sur le terrain afin de tester l'adaptabilité de différentes espèces herbacées à des conditions agroforestières réelles et simulées. Une attention particulière a toujours été accordée aux effets des systèmes de culture sur la fertilité des sols, avec un accent particulier sur la dynamique de la matière organique du sol et le potentiel d'atténuation des émissions de gaz à effet de serre dans l'atmosphère.
Sa mission est de contribuer à la mise en place d'un site de démonstration de l'agroforesterie en Italie et de mesurer les paramètres liés à la production, aux services écosystémiques, à l'atténuation du changement climatique et à la santé des sols (tâches 2.1, 2.2). En outre, il traitera des aspects financiers du système agroforestier organisé sur le site de démonstration (tâche 2.4).
- Le groupe d’étude Microbien de l'UNIPI possède une expertise dans les études sur le rôle des micro-organismes dans la production primaire, la préservation de la diversité biologique des sols, la fertilité et la nutrition des plantes. Il participe à des projets axés sur les biotechnologies pour une agriculture durable ainsi que sur l'utilisation d'agents microbiologiques comme biostimulants et biofertilisants. Il participe depuis peu à un projet axé sur la caractérisation du microbiome du sol à l'aide d'approches métagénomiques. Sa tâche consiste à analyser la dynamique des communautés bactériennes et fongiques dans des échantillons de sol prélevés sur les sites de démonstration (tâche 2.3). 

Usai G., Mascagni F., Giordani T., Vangelisti A., Bosi E., Zuccolo A., Ceccarelli M., King R., Hassani-Pak K., Solorzano Zambrano L., Cavallini A. et Natali L. Modèles épigénétiques dans le génome phasé de l'haplotype du figuier (Ficus carica L.). The Plant Journal, 2020, 102, 600–614.
Vangelisti A., Solorzano Zambrano, L. Caruso G., Macheda D., Bernardi R., Usai G., Mascagni F., Giordani T., Gucci R., Cavallini A., Natali L.. Comment une culture fruitière ancienne et tolérant le sel, Ficus carica L., fait face à la salinité : une analyse transcriptomique. Scientific Reports, 2019, 9:2561.
Agnolucci M., Avio L., Pepe A., Turrini A., Cristani C., Bonini P., Colosimo F., Ruzzi M., Giovannetti M. (2019). Bactéries associées à un inoculum AMF commercial : composition de la communauté et activité multifonctionnelle évaluées par séquençage Illumina et outils dépendants de la culture. Frontiers in Plant Science 9:1956.Knickel M., Caniglia G., Knickel K., Šūmane S., Maye D., Arcuri S., ... & Brunori G. (2023). Perdu dans le brouillard ou tirant parti des forces de ses partenaires ? Apprendre à collaborer dans trois laboratoires vivants transdisciplinaires européens. Futures, 152, 103219.
Tramacere, L.G., Antichi, D.*, Mele, M., Ragaglini, G., Mantino, A. (2024). Effets de la culture intercalaire sur la production fourragère d'un mélange binaire graminées-légumineuses (Hedysarum coronarium .L et Lolium multiflorum Lam.) sous ombrage artificiel dans des conditions méditerranéennes pluviales. Agroforestry Systems, 98/6), 1445-1460. doi:10.1007/s10457-024-01012-8